Метод

Преимущества

Ограничения / вызовы

Рекомендации

Маркеры информативности предков (AIMs)

Позволяют оценить генетическое происхождение и корректировать популяционную структуру

Требуют хорошо подобранной панели маркеров; ограничены для мелких выборок

Использовать при мультиэтнических когортах; комбинировать с другими методами

Основные компоненты (PCA)

Прост в реализации; позволяет визуализировать структуру популяции

Могут не учитывать сложные взаимодействия; чувствителен к выбросам

Применять для предварительного анализа и корректировки моделей

Модели смешанных эффектов

Учет случайных эффектов, включая родственные связи; уменьшение ложноположительных ассоциаций

Требуют больших выборок и вычислительных ресурсов

Использовать для крупных когорт и сложных фенотипов

Комбинированный подход (AIMs + PCA / Mixed models)

Высокая точность контроля; уменьшение систематических ошибок

Сложность реализации; требует качественных данных и вычислительной мощности

Рекомендуется для мультиэтнических и крупных исследований